Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SOGA3Q5TF21 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SOGA3Q5TF21 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SOGA3Q5TF21 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SOGA3Q5TF21 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SOGA3Q5TF21 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SOGA3Q5TF21 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SOGA3Q5TF21 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SOGA3Q5TF21 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SOGA3Q5TF21 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SOGA3Q5TF21 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SOGA3Q5TF21 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SOGA3Q5TF21 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SOGA3Q5TF21 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SOGA3Q5TF21 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SOGA3Q5TF21 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SOGA3Q5TF21 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SOGA3Q5TF21 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms