Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHF19Q5T6S3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF19Q5T6S3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF19Q5T6S3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PHF19Q5T6S3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF19Q5T6S3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF19Q5T6S3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF19Q5T6S3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF19Q5T6S3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF19Q5T6S3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF19Q5T6S3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF19Q5T6S3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF19Q5T6S3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF19Q5T6S3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF19Q5T6S3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF19Q5T6S3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF19Q5T6S3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF19Q5T6S3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF19Q5T6S3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF19Q5T6S3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF19Q5T6S3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF19Q5T6S3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms