Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF648Q5T619 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF648Q5T619 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF648Q5T619 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF648Q5T619 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF648Q5T619 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF648Q5T619 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF648Q5T619 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF648Q5T619 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF648Q5T619 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF648Q5T619 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF648Q5T619 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF648Q5T619 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF648Q5T619 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms