Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CT47A1Q5JQC4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CT47A1Q5JQC4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CT47A1Q5JQC4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CT47A1Q5JQC4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms