Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CMPK2Q5EBM0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CMPK2Q5EBM0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CMPK2Q5EBM0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 422.7 ms