Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
COBLL1Q53SF7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COBLL1Q53SF7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COBLL1Q53SF7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms