Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
NBPF8Q3BBV2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
NBPF8Q3BBV2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NBPF8Q3BBV2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
NBPF8Q3BBV2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NBPF8Q3BBV2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NBPF8Q3BBV2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NBPF8Q3BBV2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NBPF8Q3BBV2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NBPF8Q3BBV2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NBPF8Q3BBV2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NBPF8Q3BBV2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NBPF8Q3BBV2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NBPF8Q3BBV2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NBPF8Q3BBV2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NBPF8Q3BBV2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
NBPF8Q3BBV2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NBPF8Q3BBV2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NBPF8Q3BBV2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NBPF8Q3BBV2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
NBPF8Q3BBV2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NBPF8Q3BBV2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms