Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TYSND1Q2T9J0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TYSND1Q2T9J0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TYSND1Q2T9J0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TYSND1Q2T9J0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TYSND1Q2T9J0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TYSND1Q2T9J0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TYSND1Q2T9J0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2764.8 ms