Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TXNRD1Q16881 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TXNRD1Q16881 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TXNRD1Q16881 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TXNRD1Q16881 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TXNRD1Q16881 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TXNRD1Q16881 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TXNRD1Q16881 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TXNRD1Q16881 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TXNRD1Q16881 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
TXNRD1Q16881 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TXNRD1Q16881 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TXNRD1Q16881 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TXNRD1Q16881 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TXNRD1Q16881 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
TXNRD1Q16881 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TXNRD1Q16881 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TXNRD1Q16881 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TXNRD1Q16881 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TXNRD1Q16881 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TXNRD1Q16881 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
TXNRD1Q16881 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TXNRD1Q16881 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
TXNRD1Q16881 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TXNRD1Q16881 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TXNRD1Q16881 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TXNRD1Q16881 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TXNRD1Q16881 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
TXNRD1Q16881 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TXNRD1Q16881 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TXNRD1Q16881 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TXNRD1Q16881 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TXNRD1Q16881 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TXNRD1Q16881 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms