Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NWD1Q149M9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NWD1Q149M9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NWD1Q149M9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NWD1Q149M9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NWD1Q149M9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NWD1Q149M9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NWD1Q149M9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NWD1Q149M9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NWD1Q149M9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NWD1Q149M9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NWD1Q149M9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NWD1Q149M9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NWD1Q149M9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NWD1Q149M9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NWD1Q149M9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NWD1Q149M9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NWD1Q149M9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NWD1Q149M9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NWD1Q149M9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NWD1Q149M9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NWD1Q149M9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
NWD1Q149M9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NWD1Q149M9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NWD1Q149M9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NWD1Q149M9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NWD1Q149M9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NWD1Q149M9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NWD1Q149M9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NWD1Q149M9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
NWD1Q149M9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NWD1Q149M9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NWD1Q149M9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NWD1Q149M9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
NWD1Q149M9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NWD1Q149M9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NWD1Q149M9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
NWD1Q149M9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NWD1Q149M9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
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