Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL19A1Q14993 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL19A1Q14993 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL19A1Q14993 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
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