Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTCH1Q13635 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PTCH1Q13635 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTCH1Q13635 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTCH1Q13635 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTCH1Q13635 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
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