Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
BFSP2Q13515 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
BFSP2Q13515 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BFSP2Q13515 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BFSP2Q13515 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BFSP2Q13515 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BFSP2Q13515 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BFSP2Q13515 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BFSP2Q13515 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BFSP2Q13515 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BFSP2Q13515 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BFSP2Q13515 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BFSP2Q13515 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BFSP2Q13515 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BFSP2Q13515 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BFSP2Q13515 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BFSP2Q13515 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BFSP2Q13515 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
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