Protein–RNA interactions for Protein: Q13506

NAB1, NGFI-A-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAB1Q13506 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NAB1Q13506 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NAB1Q13506 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NAB1Q13506 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NAB1Q13506 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAB1Q13506 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAB1Q13506 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAB1Q13506 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NAB1Q13506 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAB1Q13506 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAB1Q13506 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAB1Q13506 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAB1Q13506 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAB1Q13506 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAB1Q13506 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAB1Q13506 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAB1Q13506 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NAB1Q13506 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NAB1Q13506 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAB1Q13506 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NAB1Q13506 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAB1Q13506 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAB1Q13506 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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