Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALCOCO2Q13137 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALCOCO2Q13137 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALCOCO2Q13137 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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