Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD83Q01151 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD83Q01151 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD83Q01151 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CD83Q01151 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD83Q01151 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CD83Q01151 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD83Q01151 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD83Q01151 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD83Q01151 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD83Q01151 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD83Q01151 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CD83Q01151 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD83Q01151 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD83Q01151 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD83Q01151 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD83Q01151 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD83Q01151 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD83Q01151 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD83Q01151 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD83Q01151 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD83Q01151 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD83Q01151 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD83Q01151 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CD83Q01151 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD83Q01151 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD83Q01151 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD83Q01151 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD83Q01151 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD83Q01151 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD83Q01151 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD83Q01151 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CD83Q01151 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD83Q01151 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CD83Q01151 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD83Q01151 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD83Q01151 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD83Q01151 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD83Q01151 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD83Q01151 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD83Q01151 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD83Q01151 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD83Q01151 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD83Q01151 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD83Q01151 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD83Q01151 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD83Q01151 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD83Q01151 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CD83Q01151 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD83Q01151 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD83Q01151 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD83Q01151 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD83Q01151 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD83Q01151 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD83Q01151 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD83Q01151 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD83Q01151 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CD83Q01151 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD83Q01151 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD83Q01151 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD83Q01151 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD83Q01151 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD83Q01151 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD83Q01151 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD83Q01151 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CD83Q01151 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD83Q01151 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD83Q01151 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD83Q01151 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD83Q01151 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD83Q01151 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD83Q01151 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD83Q01151 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD83Q01151 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD83Q01151 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD83Q01151 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD83Q01151 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD83Q01151 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD83Q01151 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD83Q01151 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD83Q01151 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD83Q01151 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD83Q01151 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD83Q01151 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD83Q01151 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD83Q01151 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD83Q01151 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD83Q01151 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD83Q01151 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD83Q01151 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD83Q01151 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD83Q01151 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD83Q01151 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD83Q01151 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD83Q01151 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD83Q01151 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD83Q01151 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD83Q01151 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD83Q01151 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD83Q01151 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms