Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTA1P68133 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTA1P68133 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTA1P68133 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141 ms