Protein–RNA interactions for Protein: P62269

RPS18, 40S ribosomal protein S18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS18P62269 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS18P62269 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS18P62269 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS18P62269 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS18P62269 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS18P62269 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS18P62269 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS18P62269 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS18P62269 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS18P62269 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS18P62269 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS18P62269 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS18P62269 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS18P62269 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS18P62269 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS18P62269 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS18P62269 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS18P62269 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS18P62269 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS18P62269 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS18P62269 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS18P62269 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS18P62269 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS18P62269 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS18P62269 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS18P62269 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS18P62269 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS18P62269 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS18P62269 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS18P62269 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS18P62269 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS18P62269 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS18P62269 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS18P62269 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS18P62269 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS18P62269 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS18P62269 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS18P62269 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS18P62269 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS18P62269 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS18P62269 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS18P62269 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS18P62269 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS18P62269 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS18P62269 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS18P62269 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS18P62269 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS18P62269 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS18P62269 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS18P62269 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS18P62269 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS18P62269 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS18P62269 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS18P62269 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS18P62269 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS18P62269 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS18P62269 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS18P62269 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS18P62269 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS18P62269 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS18P62269 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS18P62269 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS18P62269 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS18P62269 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS18P62269 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS18P62269 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS18P62269 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS18P62269 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS18P62269 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS18P62269 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPS18P62269 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS18P62269 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS18P62269 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS18P62269 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS18P62269 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS18P62269 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS18P62269 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS18P62269 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS18P62269 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS18P62269 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS18P62269 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS18P62269 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS18P62269 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS18P62269 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS18P62269 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS18P62269 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS18P62269 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS18P62269 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS18P62269 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS18P62269 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS18P62269 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS18P62269 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS18P62269 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS18P62269 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS18P62269 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS18P62269 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS18P62269 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS18P62269 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS18P62269 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS18P62269 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms