Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARF3P61204 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARF3P61204 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARF3P61204 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARF3P61204 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARF3P61204 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARF3P61204 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARF3P61204 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARF3P61204 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARF3P61204 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARF3P61204 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARF3P61204 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARF3P61204 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARF3P61204 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF3P61204 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF3P61204 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF3P61204 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF3P61204 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF3P61204 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARF3P61204 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF3P61204 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF3P61204 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF3P61204 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF3P61204 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF3P61204 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARF3P61204 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF3P61204 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF3P61204 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF3P61204 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF3P61204 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF3P61204 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF3P61204 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF3P61204 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF3P61204 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF3P61204 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF3P61204 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF3P61204 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF3P61204 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF3P61204 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF3P61204 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARF3P61204 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARF3P61204 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARF3P61204 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARF3P61204 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARF3P61204 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARF3P61204 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARF3P61204 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARF3P61204 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARF3P61204 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARF3P61204 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARF3P61204 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARF3P61204 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARF3P61204 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARF3P61204 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF3P61204 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF3P61204 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF3P61204 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF3P61204 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF3P61204 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF3P61204 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF3P61204 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF3P61204 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF3P61204 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF3P61204 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF3P61204 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF3P61204 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF3P61204 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF3P61204 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF3P61204 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF3P61204 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF3P61204 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF3P61204 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF3P61204 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF3P61204 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF3P61204 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF3P61204 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF3P61204 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF3P61204 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF3P61204 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARF3P61204 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARF3P61204 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARF3P61204 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARF3P61204 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARF3P61204 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARF3P61204 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARF3P61204 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARF3P61204 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARF3P61204 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARF3P61204 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARF3P61204 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARF3P61204 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARF3P61204 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARF3P61204 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARF3P61204 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARF3P61204 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ARF3P61204 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARF3P61204 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARF3P61204 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARF3P61204 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARF3P61204 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms