Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ROMO1P60602 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ROMO1P60602 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ROMO1P60602 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms