Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
OXCT1P55809 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
OXCT1P55809 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OXCT1P55809 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms