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Protein–RNA interactions for Protein: P53047
RTA1, Protein RTA1, yeast
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317 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
RTA1
P53047
YPL245W
YPL245W
1365 nt
7.2
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
AFG2
YLR397C
2343 nt
7.19
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
JIP4
YDR475C
2631 nt
7.19
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
NSE5
YML023C
1671 nt
7.19
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
YCR006C
YCR006C
474 nt
7.19
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
GGC1
YDL198C
903 nt
7.19
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
YEL074W
YEL074W
339 nt
7.19
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
THR1
YHR025W
1074 nt
7.19
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
TRR2
YHR106W
1029 nt
7.19
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
YPL067C
YPL067C
597 nt
7.19
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
MUM3
YOR298W
1440 nt
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□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
ATG18
YFR021W
1503 nt
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RTA1
P53047
YIR043C
YIR043C
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7.18
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
ALG5
YPL227C
1005 nt
7.18
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
SRL2
YLR082C
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□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
PRS4
YBL068W
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7.17
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
YOR012W
YOR012W
414 nt
7.17
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
RPN5
YDL147W
1338 nt
7.17
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
PMT3
YOR321W
2262 nt
7.16
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
PEX12
YMR026C
1200 nt
7.16
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
GET4
YOR164C
939 nt
7.16
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
HAL1
YPR005C
885 nt
7.16
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
MMS2
YGL087C
414 nt
7.15
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
GCV3
YAL044C
513 nt
7.15
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
YPQ1
YOL092W
927 nt
7.15
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
YOR268C
YOR268C
399 nt
7.15
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
SNT309
YPR101W
528 nt
7.15
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
UME1
YPL139C
1383 nt
7.15
□□□□□ -1.26
RTA1
P53047
TDP1
YBR223C
1635 nt
7.15
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
DLD1
YDL174C
1764 nt
7.15
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
IME2
YJL106W
1938 nt
7.15
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
TIP41
YPR040W
1071 nt
7.14
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
IRC5
YFR038W
2562 nt
7.14
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
PLB2
YMR006C
2121 nt
7.13
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
RCK1
YGL158W
1539 nt
7.13
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
HPT1
YDR399W
666 nt
7.13
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
SPO12
YHR152W
522 nt
7.13
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
YAL019W-A
YAL019W-A
570 nt
7.13
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
YNL228W
YNL228W
777 nt
7.13
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
YPR130C
YPR130C
408 nt
7.13
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
DEF1
YKL054C
2217 nt
7.13
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
CTA1
YDR256C
1548 nt
7.12
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
RSC2
YLR357W
2670 nt
7.12
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
PAC10
YGR078C
600 nt
7.12
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
MTR3
YGR158C
753 nt
7.12
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
PUP2
YGR253C
783 nt
7.12
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
PRE5
YMR314W
705 nt
7.12
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
CST26
YBR042C
1194 nt
7.12
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
VPS72
YDR485C
2388 nt
7.12
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
ATF1
YOR377W
1578 nt
7.12
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
YNL247W
YNL247W
2304 nt
7.11
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
CLD1
YGR110W
1338 nt
7.11
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
DBR1
YKL149C
1218 nt
7.11
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
snR34
snR34
203 nt
7.11
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
PTR2
YKR093W
1806 nt
7.11
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
AMN1
YBR158W
1650 nt
7.1
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
BRN1
YBL097W
2265 nt
7.1
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
YGL235W
YGL235W
537 nt
7.1
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
YGR068W-A
YGR068W-A
96 nt
7.1
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
GTO1
YGR154C
1071 nt
7.1
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
YAL045C
YAL045C
309 nt
7.1
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
MBF1
YOR298C-A
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□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
MSG5
YNL053W
1470 nt
7.1
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
CTF3
YLR381W
2202 nt
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□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
CIA1
YDR267C
993 nt
7.09
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
ATO2
YNR002C
849 nt
7.09
□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
PMT2
YAL023C
2280 nt
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□□□□□ -1.27
RTA1
P53047
MCH2
YKL221W
1422 nt
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□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
YEA6
YEL006W
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RTA1
P53047
CYS3
YAL012W
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7.08
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
RRT7
YLL030C
342 nt
7.08
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
ARC35
YNR035C
1029 nt
7.08
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
snR30
snR30
606 nt
7.08
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
NAF1
YNL124W
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7.08
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
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YHL021C
1398 nt
7.08
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
ADE5,7
YGL234W
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□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
SNF11
YDR073W
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RTA1
P53047
PDA1
YER178W
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□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
MPC1
YGL080W
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RTA1
P53047
JJJ3
YJR097W
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□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
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□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
HTZ1
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7.07
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
ODC2
YOR222W
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□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
CEM1
YER061C
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RTA1
P53047
YNR005C
YNR005C
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□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
YOL099C
YOL099C
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RTA1
P53047
ARH1
YDR376W
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RTA1
P53047
YEF1
YEL041W
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RTA1
P53047
ISR1
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□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
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RTA1
P53047
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YNL071W
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RTA1
P53047
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RTA1
P53047
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RTA1
P53047
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RTA1
P53047
SPC42
YKL042W
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RTA1
P53047
YMR114C
YMR114C
1107 nt
7.05
□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
RPR1
RPR1
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□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
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YOL043C
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□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
SRG1
SRG1
551 nt
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□□□□□ -1.28
RTA1
P53047
HGH1
YGR187C
1185 nt
7.04
□□□□□ -1.28
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