Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPT1P50897 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPT1P50897 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPT1P50897 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPT1P50897 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPT1P50897 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPT1P50897 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPT1P50897 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPT1P50897 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPT1P50897 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPT1P50897 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPT1P50897 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPT1P50897 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPT1P50897 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPT1P50897 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPT1P50897 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPT1P50897 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPT1P50897 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPT1P50897 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PPT1P50897 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPT1P50897 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPT1P50897 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPT1P50897 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPT1P50897 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPT1P50897 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPT1P50897 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPT1P50897 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPT1P50897 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPT1P50897 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPT1P50897 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPT1P50897 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PPT1P50897 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPT1P50897 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPT1P50897 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPT1P50897 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPT1P50897 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPT1P50897 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPT1P50897 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPT1P50897 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPT1P50897 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPT1P50897 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPT1P50897 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPT1P50897 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPT1P50897 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPT1P50897 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPT1P50897 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPT1P50897 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPT1P50897 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPT1P50897 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPT1P50897 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPT1P50897 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPT1P50897 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPT1P50897 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPT1P50897 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPT1P50897 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPT1P50897 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPT1P50897 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PPT1P50897 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PPT1P50897 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPT1P50897 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PPT1P50897 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPT1P50897 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPT1P50897 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPT1P50897 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPT1P50897 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPT1P50897 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPT1P50897 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPT1P50897 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPT1P50897 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPT1P50897 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPT1P50897 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPT1P50897 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPT1P50897 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPT1P50897 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPT1P50897 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PPT1P50897 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPT1P50897 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPT1P50897 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPT1P50897 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPT1P50897 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPT1P50897 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPT1P50897 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPT1P50897 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPT1P50897 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPT1P50897 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PPT1P50897 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPT1P50897 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPT1P50897 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPT1P50897 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPT1P50897 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPT1P50897 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPT1P50897 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPT1P50897 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPT1P50897 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPT1P50897 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPT1P50897 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPT1P50897 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPT1P50897 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPT1P50897 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPT1P50897 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms