Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR4P46093 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR4P46093 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR4P46093 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR4P46093 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR4P46093 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR4P46093 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR4P46093 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR4P46093 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR4P46093 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR4P46093 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR4P46093 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR4P46093 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR4P46093 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR4P46093 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR4P46093 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR4P46093 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR4P46093 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR4P46093 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR4P46093 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR4P46093 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR4P46093 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR4P46093 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR4P46093 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR4P46093 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR4P46093 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR4P46093 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR4P46093 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR4P46093 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR4P46093 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR4P46093 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR4P46093 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GPR4P46093 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GPR4P46093 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR4P46093 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR4P46093 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR4P46093 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR4P46093 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR4P46093 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR4P46093 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR4P46093 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR4P46093 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR4P46093 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR4P46093 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR4P46093 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR4P46093 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR4P46093 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR4P46093 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR4P46093 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR4P46093 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR4P46093 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR4P46093 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR4P46093 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR4P46093 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR4P46093 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR4P46093 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR4P46093 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR4P46093 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR4P46093 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR4P46093 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR4P46093 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR4P46093 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR4P46093 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR4P46093 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR4P46093 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR4P46093 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR4P46093 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR4P46093 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR4P46093 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR4P46093 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPR4P46093 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR4P46093 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR4P46093 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR4P46093 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR4P46093 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR4P46093 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR4P46093 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR4P46093 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR4P46093 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR4P46093 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR4P46093 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR4P46093 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR4P46093 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR4P46093 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR4P46093 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR4P46093 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR4P46093 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR4P46093 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR4P46093 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR4P46093 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR4P46093 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR4P46093 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR4P46093 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR4P46093 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR4P46093 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR4P46093 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR4P46093 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR4P46093 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR4P46093 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR4P46093 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms