Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPA3P35244 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPA3P35244 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPA3P35244 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RPA3P35244 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPA3P35244 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPA3P35244 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPA3P35244 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPA3P35244 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPA3P35244 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPA3P35244 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPA3P35244 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPA3P35244 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPA3P35244 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPA3P35244 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPA3P35244 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPA3P35244 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPA3P35244 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPA3P35244 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPA3P35244 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPA3P35244 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPA3P35244 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA3P35244 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA3P35244 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA3P35244 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA3P35244 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA3P35244 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA3P35244 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA3P35244 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA3P35244 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA3P35244 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA3P35244 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA3P35244 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA3P35244 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA3P35244 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA3P35244 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA3P35244 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA3P35244 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA3P35244 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA3P35244 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA3P35244 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA3P35244 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA3P35244 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA3P35244 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA3P35244 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA3P35244 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA3P35244 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPA3P35244 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPA3P35244 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPA3P35244 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPA3P35244 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPA3P35244 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RPA3P35244 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPA3P35244 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPA3P35244 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPA3P35244 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPA3P35244 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA3P35244 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA3P35244 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA3P35244 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA3P35244 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA3P35244 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA3P35244 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA3P35244 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA3P35244 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA3P35244 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPA3P35244 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPA3P35244 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPA3P35244 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA3P35244 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA3P35244 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPA3P35244 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPA3P35244 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPA3P35244 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPA3P35244 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPA3P35244 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RPA3P35244 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPA3P35244 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPA3P35244 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPA3P35244 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPA3P35244 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPA3P35244 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPA3P35244 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPA3P35244 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA3P35244 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA3P35244 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA3P35244 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA3P35244 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA3P35244 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA3P35244 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA3P35244 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA3P35244 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA3P35244 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA3P35244 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA3P35244 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA3P35244 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA3P35244 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA3P35244 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA3P35244 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA3P35244 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms