Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms