Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXD10P28358 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXD10P28358 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXD10P28358 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXD10P28358 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXD10P28358 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXD10P28358 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXD10P28358 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms