Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLD1P28340 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLD1P28340 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLD1P28340 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
POLD1P28340 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLD1P28340 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLD1P28340 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
POLD1P28340 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLD1P28340 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLD1P28340 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
POLD1P28340 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLD1P28340 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLD1P28340 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLD1P28340 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLD1P28340 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLD1P28340 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLD1P28340 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLD1P28340 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLD1P28340 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLD1P28340 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLD1P28340 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLD1P28340 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLD1P28340 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLD1P28340 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
POLD1P28340 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLD1P28340 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLD1P28340 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLD1P28340 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLD1P28340 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
POLD1P28340 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLD1P28340 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLD1P28340 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLD1P28340 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLD1P28340 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
POLD1P28340 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
POLD1P28340 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLD1P28340 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLD1P28340 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLD1P28340 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLD1P28340 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLD1P28340 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLD1P28340 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLD1P28340 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLD1P28340 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
POLD1P28340 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
POLD1P28340 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
POLD1P28340 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
POLD1P28340 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
POLD1P28340 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
POLD1P28340 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLD1P28340 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLD1P28340 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLD1P28340 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLD1P28340 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLD1P28340 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLD1P28340 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLD1P28340 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
POLD1P28340 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
POLD1P28340 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLD1P28340 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLD1P28340 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
POLD1P28340 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
POLD1P28340 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
POLD1P28340 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
POLD1P28340 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
POLD1P28340 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
POLD1P28340 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLD1P28340 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLD1P28340 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLD1P28340 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLD1P28340 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLD1P28340 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
POLD1P28340 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
POLD1P28340 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
POLD1P28340 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
POLD1P28340 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
POLD1P28340 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
POLD1P28340 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
POLD1P28340 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
POLD1P28340 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
POLD1P28340 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
POLD1P28340 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
POLD1P28340 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
POLD1P28340 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
POLD1P28340 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
POLD1P28340 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
POLD1P28340 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
POLD1P28340 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
POLD1P28340 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
POLD1P28340 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
POLD1P28340 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
POLD1P28340 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
POLD1P28340 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
POLD1P28340 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
POLD1P28340 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
POLD1P28340 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
POLD1P28340 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
POLD1P28340 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
POLD1P28340 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
POLD1P28340 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms