Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNI3P19429 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI3P19429 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI3P19429 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms