Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDCP19113 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDCP19113 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDCP19113 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDCP19113 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDCP19113 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HDCP19113 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDCP19113 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDCP19113 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDCP19113 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDCP19113 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDCP19113 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDCP19113 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDCP19113 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDCP19113 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDCP19113 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDCP19113 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDCP19113 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDCP19113 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDCP19113 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDCP19113 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDCP19113 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDCP19113 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDCP19113 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDCP19113 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDCP19113 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDCP19113 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDCP19113 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDCP19113 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDCP19113 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDCP19113 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDCP19113 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDCP19113 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDCP19113 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDCP19113 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDCP19113 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDCP19113 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDCP19113 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDCP19113 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDCP19113 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDCP19113 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HDCP19113 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDCP19113 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HDCP19113 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDCP19113 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDCP19113 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDCP19113 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDCP19113 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDCP19113 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDCP19113 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDCP19113 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDCP19113 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDCP19113 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDCP19113 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDCP19113 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDCP19113 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDCP19113 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDCP19113 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDCP19113 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDCP19113 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDCP19113 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDCP19113 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HDCP19113 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDCP19113 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDCP19113 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDCP19113 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDCP19113 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDCP19113 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDCP19113 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDCP19113 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDCP19113 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDCP19113 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDCP19113 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDCP19113 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDCP19113 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDCP19113 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDCP19113 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDCP19113 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDCP19113 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDCP19113 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HDCP19113 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDCP19113 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDCP19113 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDCP19113 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDCP19113 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDCP19113 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDCP19113 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDCP19113 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDCP19113 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDCP19113 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDCP19113 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDCP19113 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDCP19113 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDCP19113 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDCP19113 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDCP19113 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDCP19113 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDCP19113 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDCP19113 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDCP19113 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms