Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPN2P17655 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CAPN2P17655 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.1 ms