Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PYGBP11216 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PYGBP11216 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PYGBP11216 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PYGBP11216 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PYGBP11216 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PYGBP11216 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PYGBP11216 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PYGBP11216 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PYGBP11216 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PYGBP11216 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PYGBP11216 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PYGBP11216 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PYGBP11216 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PYGBP11216 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PYGBP11216 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PYGBP11216 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PYGBP11216 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PYGBP11216 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PYGBP11216 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PYGBP11216 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PYGBP11216 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PYGBP11216 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PYGBP11216 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PYGBP11216 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PYGBP11216 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PYGBP11216 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PYGBP11216 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PYGBP11216 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PYGBP11216 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PYGBP11216 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PYGBP11216 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PYGBP11216 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PYGBP11216 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PYGBP11216 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PYGBP11216 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PYGBP11216 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PYGBP11216 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PYGBP11216 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PYGBP11216 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PYGBP11216 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PYGBP11216 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PYGBP11216 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PYGBP11216 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PYGBP11216 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PYGBP11216 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PYGBP11216 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PYGBP11216 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PYGBP11216 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PYGBP11216 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PYGBP11216 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PYGBP11216 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PYGBP11216 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PYGBP11216 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PYGBP11216 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PYGBP11216 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PYGBP11216 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PYGBP11216 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PYGBP11216 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PYGBP11216 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PYGBP11216 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PYGBP11216 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PYGBP11216 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PYGBP11216 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PYGBP11216 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PYGBP11216 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PYGBP11216 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PYGBP11216 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PYGBP11216 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PYGBP11216 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PYGBP11216 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PYGBP11216 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PYGBP11216 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PYGBP11216 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PYGBP11216 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PYGBP11216 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PYGBP11216 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PYGBP11216 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PYGBP11216 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PYGBP11216 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PYGBP11216 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PYGBP11216 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PYGBP11216 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PYGBP11216 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PYGBP11216 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PYGBP11216 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PYGBP11216 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PYGBP11216 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PYGBP11216 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PYGBP11216 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PYGBP11216 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PYGBP11216 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PYGBP11216 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PYGBP11216 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PYGBP11216 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PYGBP11216 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PYGBP11216 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PYGBP11216 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PYGBP11216 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PYGBP11216 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms