Protein–RNA interactions for Protein: P09341

CXCL1, Growth-regulated alpha protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL1P09341 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL1P09341 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL1P09341 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL1P09341 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL1P09341 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL1P09341 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL1P09341 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL1P09341 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL1P09341 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL1P09341 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL1P09341 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL1P09341 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL1P09341 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL1P09341 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CXCL1P09341 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL1P09341 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms