Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRB1P04280 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRB1P04280 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRB1P04280 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRB1P04280 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRB1P04280 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRB1P04280 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRB1P04280 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRB1P04280 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRB1P04280 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRB1P04280 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRB1P04280 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRB1P04280 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRB1P04280 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRB1P04280 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRB1P04280 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRB1P04280 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRB1P04280 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRB1P04280 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRB1P04280 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRB1P04280 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRB1P04280 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRB1P04280 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRB1P04280 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRB1P04280 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRB1P04280 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRB1P04280 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRB1P04280 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRB1P04280 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRB1P04280 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRB1P04280 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRB1P04280 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRB1P04280 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRB1P04280 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRB1P04280 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRB1P04280 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRB1P04280 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRB1P04280 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRB1P04280 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRB1P04280 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRB1P04280 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRB1P04280 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRB1P04280 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRB1P04280 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRB1P04280 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRB1P04280 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRB1P04280 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRB1P04280 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRB1P04280 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRB1P04280 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRB1P04280 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRB1P04280 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRB1P04280 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRB1P04280 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRB1P04280 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRB1P04280 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRB1P04280 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRB1P04280 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRB1P04280 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRB1P04280 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRB1P04280 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRB1P04280 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRB1P04280 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRB1P04280 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRB1P04280 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRB1P04280 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRB1P04280 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRB1P04280 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRB1P04280 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRB1P04280 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRB1P04280 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRB1P04280 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRB1P04280 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRB1P04280 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRB1P04280 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRB1P04280 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRB1P04280 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRB1P04280 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRB1P04280 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRB1P04280 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRB1P04280 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRB1P04280 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRB1P04280 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRB1P04280 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRB1P04280 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRB1P04280 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRB1P04280 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRB1P04280 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRB1P04280 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRB1P04280 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRB1P04280 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRB1P04280 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRB1P04280 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRB1P04280 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRB1P04280 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRB1P04280 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRB1P04280 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRB1P04280 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRB1P04280 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRB1P04280 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms