Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN3O95197 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN3O95197 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN3O95197 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN3O95197 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN3O95197 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN3O95197 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN3O95197 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN3O95197 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN3O95197 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN3O95197 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN3O95197 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN3O95197 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN3O95197 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN3O95197 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN3O95197 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN3O95197 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN3O95197 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN3O95197 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN3O95197 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN3O95197 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN3O95197 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN3O95197 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN3O95197 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN3O95197 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN3O95197 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN3O95197 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN3O95197 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN3O95197 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN3O95197 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN3O95197 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN3O95197 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN3O95197 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN3O95197 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RTN3O95197 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RTN3O95197 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN3O95197 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN3O95197 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTN3O95197 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTN3O95197 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTN3O95197 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTN3O95197 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTN3O95197 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTN3O95197 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTN3O95197 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTN3O95197 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTN3O95197 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RTN3O95197 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RTN3O95197 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTN3O95197 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTN3O95197 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTN3O95197 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTN3O95197 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTN3O95197 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTN3O95197 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTN3O95197 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTN3O95197 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTN3O95197 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTN3O95197 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTN3O95197 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTN3O95197 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTN3O95197 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTN3O95197 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTN3O95197 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTN3O95197 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTN3O95197 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTN3O95197 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTN3O95197 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTN3O95197 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTN3O95197 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTN3O95197 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTN3O95197 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTN3O95197 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTN3O95197 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTN3O95197 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTN3O95197 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTN3O95197 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTN3O95197 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTN3O95197 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTN3O95197 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTN3O95197 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN3O95197 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN3O95197 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN3O95197 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN3O95197 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN3O95197 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN3O95197 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN3O95197 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN3O95197 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN3O95197 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN3O95197 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN3O95197 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN3O95197 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RTN3O95197 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTN3O95197 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTN3O95197 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTN3O95197 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN3O95197 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN3O95197 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN3O95197 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms