Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIPA1L1O43166 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SIPA1L1O43166 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms