Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B1O00203 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3B1O00203 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms