Protein–RNA interactions for Protein: O00168

FXYD1, Phospholemman, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD1O00168 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FXYD1O00168 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FXYD1O00168 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FXYD1O00168 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FXYD1O00168 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FXYD1O00168 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXYD1O00168 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXYD1O00168 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXYD1O00168 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXYD1O00168 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXYD1O00168 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXYD1O00168 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXYD1O00168 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXYD1O00168 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FXYD1O00168 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FXYD1O00168 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FXYD1O00168 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FXYD1O00168 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FXYD1O00168 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FXYD1O00168 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FXYD1O00168 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FXYD1O00168 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FXYD1O00168 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FXYD1O00168 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms