Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC188H7C350 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC188H7C350 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC188H7C350 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms