Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms