Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC179H3BU77 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC179H3BU77 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC179H3BU77 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC179H3BU77 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC179H3BU77 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC179H3BU77 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC179H3BU77 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms