Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E9PQ18 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E9PQ18 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E9PQ18 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E9PQ18 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E9PQ18 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E9PQ18 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E9PQ18 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E9PQ18 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
E9PQ18 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E9PQ18 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E9PQ18 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E9PQ18 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E9PQ18 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E9PQ18 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E9PQ18 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E9PQ18 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PQ18 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PQ18 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PQ18 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PQ18 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PQ18 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PQ18 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PQ18 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PQ18 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PQ18 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PQ18 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PQ18 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E9PQ18 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E9PQ18 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E9PQ18 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PQ18 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PQ18 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PQ18 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PQ18 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PQ18 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PQ18 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PQ18 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PQ18 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PQ18 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PQ18 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PQ18 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PQ18 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PQ18 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PQ18 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PQ18 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PQ18 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PQ18 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PQ18 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PQ18 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PQ18 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PQ18 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PQ18 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PQ18 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PQ18 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PQ18 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PQ18 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PQ18 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PQ18 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PQ18 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PQ18 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PQ18 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PQ18 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PQ18 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PQ18 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PQ18 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PQ18 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PQ18 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PQ18 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PQ18 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PQ18 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PQ18 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PQ18 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PQ18 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PQ18 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PQ18 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PQ18 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PQ18 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PQ18 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PQ18 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PQ18 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PQ18 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PQ18 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PQ18 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PQ18 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PQ18 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PQ18 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PQ18 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PQ18 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PQ18 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PQ18 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PQ18 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PQ18 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PQ18 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E9PQ18 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E9PQ18 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PQ18 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PQ18 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PQ18 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PQ18 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms