Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HHLA1C9JL84 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HHLA1C9JL84 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HHLA1C9JL84 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms