Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PATL2C9JE40 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PATL2C9JE40 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PATL2C9JE40 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms