Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOBPA7XYQ1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SOBPA7XYQ1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SOBPA7XYQ1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
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