Protein–RNA interactions for Protein: A6NJR5

Putative speedy protein-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJR5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A6NJR5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
A6NJR5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
A6NJR5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A6NJR5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A6NJR5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A6NJR5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A6NJR5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A6NJR5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A6NJR5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A6NJR5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A6NJR5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A6NJR5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A6NJR5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A6NJR5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A6NJR5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A6NJR5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A6NJR5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A6NJR5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A6NJR5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A6NJR5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A6NJR5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A6NJR5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A6NJR5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A6NJR5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A6NJR5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A6NJR5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A6NJR5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
A6NJR5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A6NJR5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A6NJR5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A6NJR5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
A6NJR5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
A6NJR5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A6NJR5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
A6NJR5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A6NJR5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A6NJR5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A6NJR5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A6NJR5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A6NJR5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
A6NJR5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
A6NJR5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A6NJR5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A6NJR5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
A6NJR5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
A6NJR5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A6NJR5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A6NJR5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.55■■■□□ 2
A6NJR5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.55■■■□□ 2
A6NJR5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
A6NJR5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A6NJR5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A6NJR5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.53■■■□□ 2
A6NJR5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A6NJR5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A6NJR5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A6NJR5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
A6NJR5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
A6NJR5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A6NJR5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
A6NJR5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A6NJR5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
A6NJR5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A6NJR5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A6NJR5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A6NJR5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A6NJR5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A6NJR5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A6NJR5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A6NJR5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A6NJR5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A6NJR5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A6NJR5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A6NJR5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A6NJR5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A6NJR5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A6NJR5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A6NJR5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A6NJR5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
A6NJR5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A6NJR5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A6NJR5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A6NJR5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A6NJR5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
A6NJR5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
A6NJR5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
A6NJR5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A6NJR5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
A6NJR5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A6NJR5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A6NJR5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A6NJR5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A6NJR5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A6NJR5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A6NJR5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A6NJR5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A6NJR5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A6NJR5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A6NJR5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms