Protein–RNA interactions for Protein: A1X283

SH3PXD2B, SH3 and PX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3PXD2BA1X283 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SH3PXD2BA1X283 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3PXD2BA1X283 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms