Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
POTEB3A0JP26 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POTEB3A0JP26 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POTEB3A0JP26 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.56■■■□□ 2
POTEB3A0JP26 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.6 ms