Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2E0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2E0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0B4J2E0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0B4J2E0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms