Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMT12Q53H54 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms